تروى المزارع بمياه الري المأخوذة من الأفلاج والآبار والعيون، كما توجد مساحات محدودة تروى بمياه التحلية والمياه المعالجة، وتستخدم القنوات المفتوحة المبطنة والأنابيب لنقل المياه من المصدر إلى الحقول، وتقدر فواقد النقل في السلطنة بنحو 173 مليون 3م سنوياً وتصل كفاءة النقل نحو 84%.

يمارس الري داخل الحقل بنظم الري التقليدي كالألواح Borders والأحواض Basins والمروز Furrows، ونظم الري الحديثة كالرش بنوعيه الثابت Solid systems والمحوري Center pivot، والري بالنافورة Bubble والري بالتنقيط Drip  بنوعيه السطحي وتحت السطحي.

تشكل نسبة المساحات التي تروى بنظم الري الحديث نحو 15% وهي نسبة منخفضة تحتاج إلى وضع خطة طموحة تهدف إلى معالجة العجز المائي.

تبلغ كفاءة الري بنظم التقليدية نحو (30 – 40) % ولنظام الري بالرش (60 – 80) % وللري بالنافورة (85 – 90) %، وقد تصل كفاءة الري بالتنقيط إلى (95) %.

وتسعى الوزارة إلى تحسين ورفع كفاءة الري من خلال تبني العديد من المشاريع أهمها مشروع تطوير النظم المزرعية التقليدية في أراضي الأفلاج. كما تقدم الوزارة الدعم المالي والفني للمزارعين بهدف زيادة مساحات الأراضي التي تروى بنظم الري الحديثة.